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ⓘ Southwestern blot




                                     

ⓘ Southwestern blot

Il Southernwester blot è un metodo per identificare proteine che legano DNA, basato sulla separazione elettroforetica delle proteine e successivo trasferimento su membrana - usa una combinazione di Western e Southern blotting, da cui il nome.

Passaggi:

  • infine, il blot viene ibridizzato con una sonda radioattiva e processato come al solito rimuovendo la sonda non legata o in eccesso, mediante lavaggi.
  • il blot viene fatto rinaturare per rimuovere lSDS e permette interazione DNA/PROTEINA;
  • un estratto proteico, in cui si presume esserci una DNA binding protein, viene separato su 2D PAGE isoelettrofocusing seguito da SDS/PAGE e successivamente elettrotrasferito su membrana;

Il legame DNA/PROTEINA viene rilevato con leventuale ottenuto con sistemi di rilevazione del segnale della sonda marcata autoradiografia, chemioluminescenza.

Dunque, southwestern blot indicano presenza di proteine capaci di legare una sequenza data, fornendo contempo, informazioni sul loro punto isoelettrico e peso molecolare.